1091學期 課程基本資料/Course Information
系所 / 年級
課號 / 班別
學分數
選 / 必修
科目中文名稱
科目英文名稱
主要授課老師
開課期間
人數上限
已選人數
課程種類
課程類別
學程
全英授課
起始週 / 結束週 / 上課地點 / 上課時間
第1週 / 第18週 / H406 / 星期1第5節
第1週 / 第18週 / H406 / 星期1第6節
第1週 / 第18週 / H406 / 星期1第7節
第1週 / 第18週 / H406 / 星期1第6節
第1週 / 第18週 / H406 / 星期1第7節
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教學綱要/syllabus
第一部分/Part I(※依課程委員會審議之內容決議填入)
一、教學目標所要達成之能力培養項目:
[依據課程委員會審議通過之課程與基本素養/核心能力關聯表填寫]
| Item | 基本素養/核心能力 Core Literacy/Core Competencies | 相關性 Relevance | |
| 高度相關 | 中度相關 | ||
| 1 | 具備生物、醫學、資訊及數學基礎理論能力 |  |
. |
| 2 | 善盡社會責任具備電腦分析基礎理論與實作能力 | . |
. |
| 3 | 具備邏輯分析與程式設計能力 | . |
. |
| 4 | 具備團隊協調合作之能力 | . |
. |
| 5 | 擁有使用及開發資訊技術來分析解決相關問題之能力 | |
. |
| 6 | 具備學習生醫資訊相關新知和因應領域發展趨勢之能力 | |
. |
| 7 | 具備人文通識與專業倫理認知之能力 | . |
. |
| SDGs Item | SDGs目標 SDGs goal |
SDGs描述 SDGs description |
| 4 | 教育品質 Quality Education |
確保包容與公平之教育及終身學習 Ensure Inclusive and Equitable Quality Education and Promote Life-long Learning Opportunities for All |
| 11 | 永續城市與社區 Sustainable Cities & Communities |
建立具包容性、安全、活力及永續的城市和人群聚落 Make Cities and Human Settlement Inclusive, Safe, Resilient and Suitable |
二、教學目標
(Objective)
生物資訊軟體應用主要介紹各種生物資料庫及其分析工具,透過一個個研究案例, 啟發學生思考並做整合性之推論, 進而熟悉各式資料庫與工具之使用. 最後應用於研究上.
2.技能面[使學生能獲得運用與實做本課程理論與概念之技巧]：
習得各種生物資料庫/工具之使用, 並實際應用於生物資訊研究分析.
3.情意面[能引發學生對本課程之興趣，激發學生學習動機，增加觸類旁通與自主學習]：
配合上課內容, 設計各種研究案例供學生練習. 激發學生思考與學習之動機. 另配合課程內容, 由學生分組報告專題, 產生良性同儕競爭, 增加自主學習.
三、符合教學目標之課程內容設計
四、先修科目
(Pre Course)
第二部分/Part II
一、多元教學方法
(Teaching Method)
| 由學生自訂學習目標與抱負水準 | 案例或故事討論 | 講述 | |
| 學生課後書面報告 | 小組討論 | 學生上台報告 | 腦力激盪 |
| 學生實作 | 角色演練 | 習題練習 | 影片欣賞與討論 |
| 採訪 | e化教學 | 審議式民主 | 觀察與資料收集 |
| 一分鐘回饋 | 磨課師課程 | 翻轉教學 | 其他 |
| 企業參訪 | 與課程有關之實務學習 | 見習 | 實習 |
| 協同教學 | 服務學習課程 | 其他系課程委員會核定之實務學習項目 | 以「技能導向」的教學設計 |
| 以「病人為中心」的教學設計 | 問題導向教學法 | 設計導向教學法 | 專題導向教學法 |
| 總結性教學法 | 導入USR計畫成果 | 同步和非同步設計 | 整體課程鷹架設計 |
| 問題導向設計 | 主題或個案討論 | 數位説故事 | 引導學生有效學習策略（如，WSQ, WPAQ, SQ3R） |
| 群體決策（線上投票） | 同儕合作專題學習 | 同儕回饋 | 同儕亙評 |
| 同儕出題 | 同儕師徒制（高分和低分一組） | 同儕透過網路協作共同完成作業或專題 | 小組報告 |
| 小組競賽 | 課堂中每段落實施簡易小測驗 | 學生訂正學習策略 | 學生學習行為增強措施 |
| 課堂末回饋（學生回饋學習心得和疑問） | 學生線上學習歷程分析 | 線上搶答 | |
二、多元教學方法與教育目標的連結
| 您所勾選之教學方法與何種基本素養/核心能力有關? | 1 | 5 | 6 |
| 1.講述 | 2.學生上台報告 | 3.翻轉教學 | 4.服務學習課程 | 5.其他系課程委員會核定之實務學習項目 | 6.專題導向教學法 |
三、參考書目 (Reference)
[符合教學目標之參考書目]
| 中文參考書目 | 1. 生物資訊輕輕鬆鬆學 合記圖書出版社 2. 基礎生物資訊實務 李炎 編著 藝軒出版社 3. 醫學生物資訊學 合記圖書出版社 |
| 英文參考書目 | 1. Bioinformatics for Dummies. Wiley Publishing, Inc. 2. Basic Bioinformatics Practice. Yihsient Publishing, Inc. 3. Medical Bioinformatics |
四、教學進度
(Syllabi)
[符合教學目標之教學進度]
| 日期 (Date) |
授課內容 (Course Contents) |
授課教師 (Teacher) |
核心能力 | 授課方式 (Teaching methods) |
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| 1 | 5 | 6 | ||||
| 2020/9/21 | 課程介紹
生物資訊學簡介
分子生物學簡介 Introduction of Biology and Bioinformatics. |
詹雯玲 | ||||
| 2020/9/28 | 三大基因資料庫
NCBI
DDBJ
EMBL
Introduction of Genome Databases, such as NCBI, DDBJ and EMBL. |
詹雯玲 | ||||
| 2020/10/5 | 序列的產生與分析
1. 如何抓取單/多筆序列?
2. 如何分析單/多筆序列?
How to catch and analyze the sequences? 1. single seq. 2. multiple seq. |
詹雯玲 | ||||
| 2020/10/12 | 人類基因庫之應用
1. GenBank
2. EST
3. SNP
4. OMIM
5. GEO Application of human gene bank. 1. GenBank 2. EST 3. SNP 4. OMIM 5. GEO |
詹雯玲 | ||||
| 2020/10/19 | 特定功能資料庫之介紹
1. UCSC
2. Ensembl
3. ENCODE
4 GeneCards
5. TRANSFAC
6. COSMIC Introduction of specific functional databases. 1. UCSC 2. Ensembl 3. ENCODE 4 GeneCards 5. TRANSFAC 6. COSMIC |
詹雯玲 | ||||
| 2020/10/26 | 基因分析工具
1. gene structure
2. promoter
3. exon, intron, 3'-UTR
4. coding, non-coding
5. ncRNA, siRNA, lncRNA
6. repeat The tools for studying the function of genes. 1. gene structure 2. promoter 3. exon, intron, 3'-UTR 4. coding, non-coding 5. ncRNA, siRNA, lncRNA 6. repeat |
詹雯玲 | ||||
| 2020/11/2 | 基因表現分析
1. microarray analysis
2. NGS (Next Generation Sequencing)analysis
Gene expression profiles 1. microarray analysis 2. NGS (Next Generation Sequencing)analysis |
詹雯玲 | ||||
| 2020/11/9 | 基因功能分析
1. gene annotation
2. gene ontology
3. pathway analysis
4. metabolism analysis 1. gene annotation 2. gene ontology 3. pathway analysis 4. metabolism analysis |
詹雯玲 | ||||
| 2020/11/16 | 期中考 Midterm test |
詹雯玲 | ||||
| 2020/11/23 | 其他有用的生物工具
1. primer designed
2. restriction enzyme designed
3. phylogenetics tree
Other tools 1. primer designed 2. restriction enzyme designed 3. phylogenetics tree |
詹雯玲 | ||||
| 2020/11/30 | 蛋白質資料庫及工具分析
1. 2D/3D
2. protein interaction
3. drug designed 1. 2D/3D 2. protein interaction 3. drug designed |
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| 2020/12/7 | 研究案例實作1 Research issue 1 |
詹雯玲 | ||||
| 2020/12/14 | 研究案例實作2
學生專題報告 Research issue 2 project presentation |
詹雯玲 | ||||
| 2020/12/21 | 研究案例實作3
學生專題報告 Research issue 2 project presentation |
詹雯玲 | ||||
| 2020/12/28 | 研究案例實作4
學生專題報告 Research issue 4 project presentation |
詹雯玲 | ||||
| 2021/1/4 | 研究案例實作5
學生專題報告 Research issue 5 project presentation |
詹雯玲 | ||||
| 2021/1/11 | 研究案例實作6
學生專題報告 Research issue 6 project presentation |
詹雯玲 | ||||
| 2021/1/18 | 期末考 Final test |
詹雯玲 | ||||
五、多元評量方法
(Evaluation)
[所勾選評量方法之評分加總為100分]
| 評量方式 | 分數 | 評量方式 | 分數 |
| 實作測驗 | 0 | 期中筆試 | 0 |
| 隨堂筆試測驗 | 0 | 期末筆試 | 0 |
| 小組作業 | 0 | 期中報告 | 30 |
| 服務日誌 | 0 | 期末報告 | 30 |
| 口試 | 0 | 專題報告 | 30 |
| 個人上台報告 | 0 | 實作作品與反思 | 0 |
| 小組上台報告 | 0 | 前後測比較進步與成長 | 0 |
| 出席狀況 | 10 | 課堂參與與表現 | 0 |
| 心得與反思報告 | 0 | 其他 | 0 |
六、多元評量方法與教育目標的連結
| 您所勾選之評量方法與何種基本素養/核心能力有關? | 1 | 5 | 6 |
| 1.期中報告 | |||
| 2.期末報告 | |||
| 3.專題報告 | |||
| 4.出席狀況 |